1)Да, в этом релизе отключенное PAE критично, так как в гипервизоре отсутствует контроль за разделением адресного пространства и считается что Windows не выходит за границы 4ГБ.
2)тут сама формулировка вопроса не правильная, контроль за прикладными программами отношения к BIOS не имеет.
3)работает строго при выключенном UEFI (legacy mode)